Sok vállalkozás a tanúsítvány megszerzése után lankad el, pedig a rendszer fenntartása legalább annyira fontos, mint a bevezetés.
Rendszeres felülvizsgálat
A veszélyelemzést és az eljárásokat érdemes évente, illetve minden jelentősebb változás (új termék, új beszállító, technológiaváltás) után átnézni.
A csapat bevonása
A rendszer csak akkor működik hosszú távon, ha a dolgozók is értik, miért fontosak az egyes lépések, nem csupán végrehajtják azokat.
A folyamatos karbantartás sokkal kevesebb erőforrást igényel, mint egy elhanyagolt rendszer utólagos helyreállítása.